Posle nekoliko uspešnih sezona u eliti i osvojenog trofeja u Kupu Srbije 2015. godine, futsaleri Bečeja 2003 nakratko su bili u regionalnim ligama. Međutim, minule sezone su se prošetali Vojvođanskom ligom i izborili povratak u savezni rang takmičenja, Drugu ligu Srbije.
